Згідно з інструкцією з медичного застосування бактеріофаги рекомендується приймати за годину до їди. Малюкам перших місяців за відсутності блювоти і відрижки можна змішувати з грудним молоком або з невеликою кількістю кип'яченої води у співвідношенні 1:2 у перші два прийоми..
У деяких випадках (наприклад, щоб перевірити переносимість препарату у дітей перших місяців життя) препарат можна, можливо розвести кип'яченою водою або стерильним фізіологічним розчином кімнатної температури не більше ніж у два рази.
Бактеріофаг використовують для полоскання, промивання, закапування, введення змочених турундів (залишаючи їх на 1 годину). При ентеральних інфекціях, дисбактеріозі кишечника препарат приймають внутрішньо 3 рази на день за 1 годину до їди.
Дітям перших днів життя у перші два прийоми стафілококовий бактеріофаг розводять кип'яченою водою у 2 рази. У разі відсутності побічних реакцій (відрижка, висипання на шкірі) надалі застосовують нерозведений препарат. У цьому випадку його можна змішати із грудним молоком.