Згідно з інструкцією з медичного застосування препарату протипоказання до застосування препарату Тауфон є індивідуальна підвищена чутливість до таурину; дитячий вік до 18 років.
Препарат застосовується місцево шляхом інстиляцій у кон'юнктивальний мішок. При катаракті по 1-2 краплі 2-4 десь у день протягом трьох місяців. Курс повторюють із місячним інтервалом. При травмах та дистрофічних захворюваннях рогівки по 1-2 краплі 2-4 рази на день протягом одного місяця.
Потенційні побічні ефекти лікарі настійно рекомендують не приймати таурін без попередньої консультації.