За історичними даними, після того, як тут були страчені посли Чингісхана, в 1219 місто було обложено монгольськими військами під керівництвом синів Чингісхана.
При поході до Отрару Чингіз-хан залишив для нього облоги війська під керівництвом синів Чагата та Угедея. Джучи-хана відправив до низовин Сирдар'ї – міста Дженд і Янгикент, третій загін пішов підкорювати міста у верхів'ях Сирдар'ї, а сам Чингіз-хан з основними силами пішов на Бухару.
Напад монголів та облога Отрара У вересні 1219 року монгольське військо, що складалося зі 150 тисяч чоловік, підійшло до Отрару. Облогою міста зайнялися Чагатай, Угедей, Субедей та інші воєначальники. Каїр-хан із 50-тисячним військом зайнявся обороною міста.
Отрар – одне з найдавніших міст Середньої Азії. Вперше був згаданий як рідний край всесвітньо відомого філософа та математика Абу-Наср Аль-Фарабі у IX столітті, чиї роботи мали величезний вплив на філософію Європи та Близького Сходу. У 1219 році Отрар впав через настання армії Чингісхана.