Дітям з масою тіла 12-35 кг – 40 мг/кг/добу. Курс – 3 дні. Для лікування інших форм амебіазу: дорослим і дітям віком від 12 років – по 0.5 г внутрішньо вранці та ввечері протягом 5-10 днів.
Орнідазол приймають внутрішньо після їди, запиваючи достатньою кількістю води. Дорослим і дітям з масою тіла понад 35 кг по 1 таблетці 2 рази на добу (вранці та ввечері) протягом 5 днів.
Орнідазол ефективний відносно Trichomonas vaginalis, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia (Giardia intestinalis), а також деяких анаеробних бактерій, таких, як Bacteroides spp. та Clostridium spp., Fusobacterium spp., та анаеробних коків: Peptostreptococcus spp.
Відновлена 5-нітрогрупа орнідазолу взаємодіє з ДНК клітинами мікроорганізмів, інгібуючи синтез їхніх нуклеїнових кислот, що веде до загибелі бактерій. Активний щодо Trichomonas vaginalis, Giardia lamblia. Entamoeba histolytica, а також анаеробів Bacteroides spp.